Las academias de la ciudad están divididas en sus propios distritos y se consideran en su mayoría independientes. El Consejo General de Estudiantes actúa como junta de gobierno para gestionar las academias en su conjunto. Sin embargo, la capacidad de gobierno del grupo se ha visto interrumpida desde la misteriosa desaparición del presidente del Consejo General de Estudiantes. Un sinfín de problemas han empezado a surgir en todo Kivotos en ausencia del liderazgo del presidente. Para evitar el desastre, el Consejo General de Estudiantes solicita ayuda al Club de Investigación Federal, también conocido como Schale. De hecho, Schale es el club más nuevo de la ciudad y el último en ser aprobado antes de la desaparición del presidente. Para llevar a cabo su tarea, Schale cuenta con la orientación de un Sensei que puede ayudarles a resolver los incidentes en torno a Kivotos.