La historia de la película comienza cuando Arata toca inadvertidamente Hermes Apocrypha, el grimorio de Lilith. De repente, lo envuelve una luz blanca brillante y una niña aparece ante él. Se hace llamar Lilim y trata a Arata y Lilith como a sus padres. Al mismo tiempo que aparece, algo cambia en el mundo. La Biblioteca Eterna Prohibida despierta. En la Biblioteca está sellada la máxima culminación de la Alquimia, el Señor Demonio Blanco. El White Demon Lord planea eliminar a Arata y Trinity Seven para usurpar la posición de Demon Lord. Rebosante de poder incalculable, el White Demon Lord ataca a Arata y desencadena una crisis desesperada en la que Arata y Trinity Seven deben salvar al mundo en esta última batalla.
